Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms