Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFAMQ00059 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms