Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAE1P78406 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAE1P78406 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAE1P78406 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms