Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms