Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms