Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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