Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRXP46100 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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