Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSFMP43897 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSFMP43897 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSFMP43897 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSFMP43897 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSFMP43897 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSFMP43897 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSFMP43897 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSFMP43897 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSFMP43897 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSFMP43897 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TSFMP43897 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSFMP43897 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSFMP43897 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSFMP43897 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSFMP43897 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms