Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP3P42574 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP3P42574 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP3P42574 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP3P42574 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP3P42574 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP3P42574 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP3P42574 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP3P42574 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP3P42574 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms