Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MLH1P40692 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MLH1P40692 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MLH1P40692 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MLH1P40692 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MLH1P40692 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MLH1P40692 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MLH1P40692 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MLH1P40692 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MLH1P40692 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MLH1P40692 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MLH1P40692 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MLH1P40692 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MLH1P40692 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MLH1P40692 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MLH1P40692 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MLH1P40692 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MLH1P40692 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MLH1P40692 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MLH1P40692 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MLH1P40692 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MLH1P40692 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms