Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DUSP1P28562 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DUSP1P28562 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DUSP1P28562 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
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