Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms