Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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PTPRAP18433 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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PTPRAP18433 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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PTPRAP18433 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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PTPRAP18433 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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