Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF3P17036 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms