Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VPREB1P12018 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms