Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL3O95236 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL3O95236 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL3O95236 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL3O95236 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL3O95236 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL3O95236 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL3O95236 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL3O95236 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL3O95236 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL3O95236 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL3O95236 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL3O95236 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL3O95236 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL3O95236 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL3O95236 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL3O95236 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms