Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYNGR2O43760 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYNGR2O43760 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms