Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E2F3O00716 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F3O00716 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F3O00716 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms