Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPIPB9F8W1W9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms