Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms