Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms