Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTLL13PA6NNM8 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms