Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLF12Q9Y4X4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KLF12Q9Y4X4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms