Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4BQ9Y4P1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms