Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms