Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVW-1Q9UQF0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms