Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RABGEF1Q9UJ41 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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RABGEF1Q9UJ41 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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RABGEF1Q9UJ41 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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RABGEF1Q9UJ41 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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RABGEF1Q9UJ41 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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RABGEF1Q9UJ41 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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