Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM8A1Q9UBU6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms