Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK13-1Q9NX77 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms