Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPMQ9NSP4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms