Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBQLN4Q9NRR5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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