Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IL1RAPQ9NPH3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IL1RAPQ9NPH3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms