Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIN28AQ9H9Z2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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