Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF6Q9BYE7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms