Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms