Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms