Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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