Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FYCO1Q9BQS8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FYCO1Q9BQS8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms