Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms