Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms