Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms