Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BORCS6Q96GS4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms