Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTUB2Q96DC9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms