Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms