Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms