Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLP1Q92989 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms