Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNDC9Q8TBE3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms