Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LRRC17Q8N6Y2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LRRC17Q8N6Y2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LRRC17Q8N6Y2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LRRC17Q8N6Y2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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LRRC17Q8N6Y2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LRRC17Q8N6Y2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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LRRC17Q8N6Y2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC17Q8N6Y2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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