Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y1

FBXW8, F-box/WD repeat-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW8Q8N3Y1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW8Q8N3Y1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms