Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms